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澳门葡京开户网址,GigaScience:初次发布全体现生企鹅物种基因组测序

“企鹅基因组同盟”正在盛开获取期刊GigaScience初次发布了全体现生企鹅物种的基因组数据。该同盟由来自中邦、丹麦、新西兰、澳大利亚、阿根廷、南非、英邦、美邦和德邦的研讨人员构成。此次发布的数据蕴含19种全新的高掩盖度企鹅基因组序列,加上先前曾经发外正在GigaScience 的2种企鹅基因组,目前全体现生企鹅物种的全基因组曾经被完全解读。该同盟计划通过对统统企鹅目开展比较基因组学研讨,诠释企鹅物种演化过程和人类举止及气候环境变化对企鹅种群的影响等沉要根底问题。

企鹅相比于其他鸟类,拥有诸多特殊生理样式特性,不同企鹅物种之间展现了丰硕的异质性。企鹅的散布范畴横跨统统南半球:从地处赤路的加拉帕戈斯群岛,到新西兰温带海洋性气候的森林,再到近南极岛屿的礁石,直至南极洲附近的海冰。从会飞的海鸟转变为失踪飞行能力的潜泳健将是企鹅的标志性演化特性。这一变化过程伴跟着大宗的生理结构的变化,比如特化的前肢结构,更为光滑的皮肤外层,又短又硬的羽毛以及更为矫捷的体温调节系统是它们适应不同环境(从热带加拉帕戈斯群岛到极冷的南极海冰)的生理根底。

由于企鹅对环境和气候的变化极其敏感,以是被比作�海洋中的金丝雀�。近几十年来,许多企鹅种群的个体数量锐减,比方,帝企鹅的数量正在短短30年内降落了88%。其他企鹅物种的境况也摇摇欲坠。气候变暖、生境退化、海洋资源开发、渔业捕获、环境传染以及表来捕食者的引入是企鹅个体数量不息削减的沉要缘由。于是,企鹅成为许多生态系统监测研讨的批示性物种。而获得全体现生企鹅物种的高质量基因组图谱则是了解种群数量降落缘由的沉要根底数据。

来自新西兰奥塔哥大学(University of Otago)的作家Theresa Cole说:�我们能够通过这些企鹅的基因组了解它们的种群历史。该研讨将为全体企鹅物种正在极度气候环境中的种群变化历史提供新的数据信休,并可辅助预测未来气候变化对企鹅种群演化趋势的影响。这项研讨还将有助于我们了解气候变化对其他物种的影响,以援手我们拟订物种保育策略。�

这21种企鹅的物种辐射演化模式与知名的达尔文地雀相似,可认为研讨物种发源与分解的研讨提供新的模式系统。该同盟也正在对近期灭尽的企鹅举行基因组测序,还对每个物种的多个个体举行了沉测序和种群基因组学研讨。

这项工作的通信作家、来自哥本哈根大学、同时也是华大基因以及昆明动物研讨所的张邦捷传授说:�企鹅的祖先阅历了急剧的辐射分解,时期大宗的物种曾经灭尽,最终形成了20多个现存物种。这些物种的演化过程与过去地球5000万年以后的地质机关历史及气候变化亲昵相闭。于是,企鹅的辐射分解是研讨物种形成与环境作用闭系的典型代外物种类群。�

征集这些企鹅的高质量样本极具挑战,因为其中许多物种散布正在地球上最不合适生物寓居和最偏远的角落。而取样的另一个挑战来自于各邦文化差异而非手艺本身。正在过去漫长的历史里,许多地区的企鹅物种曾经深深的融入当地民族的传统文化里。为处理这一敏感问题,该同盟与这些族群间成立了充沛的信任,共同研讨当地企鹅的历史。

共同作家、新西兰生态环保部的Bruce McKinlay夸大说:�新西兰的基因组研讨目前正成为本邦文化不因素离的新因素。企鹅正在毛利文化中被称为�宝藏�(Taonga),本同盟与当地族群举行了严格的协商才得以对这6个来自新西兰的企鹅物种开展基因组测序。我们置信这些基因组信休将成为毛利文化的沉要构成部分。�

企鹅基因组同盟计划的指标不单是获得高质量的企鹅基因组图谱。这些基因组曾经对企鹅人命之树和进化历史的沉建,以及它们对南极洲适应性进化的模式研讨带来了十分有价值的成果。比方,该研讨中的一个开端的系统发育树分析外明企鹅屡次适应南极洲的极度环境。

这21种企鹅的基因组数据只是万里长征的第一步;企鹅基因组同盟迎接感兴致的研讨者插手该同盟,共同为目前正正在举行的比较基因组学和进化基因组学研讨作出贡献。

虽然该研讨尚正在举行中,但前期的21种企鹅基因组数据曾经可用,研讨者要求计划运用这些数据举行相似的种间比较的团队遵照劳德代尔堡协定(Fort Lauderdale Agreement)和多伦多宣言(The Toronto statement)。


原文缘故

Pan et al. High-coverage genomes to elucidate the evolution of penguins. 2019. GigaScience doi:

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